Модель IRIS по активности генов восстанавливает, какие сигналы получала клетка при развитии; предсказание для клеток лёгкого подтвердили опыты
Материал подготовлен Sintelligent с помощью ИИ. Опубликовано в SI: . Обновлено: .
ИИ учится «читать» историю сигналов клетки по активности генов — это может помочь выращивать нужные ткани, но пока для шести путей.
По данным phys.org, исследователи Массачусетского технологического института и Института Уайтхеда (руководитель — Пулин Ли, первый автор — Николас Хатчинс) создали нейросетевую модель IRIS, которая по «отпечаткам» активности генов восстанавливает, какие химические сигналы клетка получала при развитии. Модель обучали на большом наборе данных о реакции тысяч человеческих эмбриональных стволовых клеток на десятки сочетаний шести основных сигнальных путей. Она предсказала моменты и места активации путей в клетках мышиного эмбриона, из которых развиваются сердце, кишечник, мышцы и спинной мозг, и работает на ещё не встречавшихся типах клеток; предсказанные сигналы для клеток лёгкого подтвердили эксперименты. Работа опубликована в Nature Methods; ограничение — всего шесть путей, применимость ко всему набору клеточных сигналов ещё предстоит показать.
Источники 1